Основная задача национального парка — охрана природных комплексов. Для того, чтобы эффективно охранять природу, необходимо знать, кто и в каком количестве обитает на территории парка. Для этого ежегодно сотрудники парка проводят зимние маршрутные учеты животных, во время которых определяется численность пятнадцати так называемых охотничьих видов (хотя охота на территории парка запрещена). Учеты необходимы для того, чтобы выяснить, сколько животных одного вида примерно обитает на территории, сделать выводы об изменениях их численности.

          Проведение зимних учетов — непростое занятие, на которое влияет много факторов. Здесь важна погода — учеты не проводятся во время очень сильных морозов, продолжительных оттепелей, когда появляется наст, дует сильный ветер, идет снег. Во время учетов нельзя пользоваться автомототранспортом, ходить с собакой.

На территории парка, во всех лесничествах, проложено 26 маршрутов каждый протяженностью около 10 км. Учеты проводят государственные инспектора по охране территории, которые проходят по каждому маршруту дважды. В первый раз проводится затирка – т.е. стираются все имеющиеся следы. На следующий день, проходя по маршруту, сотрудники фиксируют все пересекающие его следы, определяя вид животного. Полученные на всех маршрутах данные суммируются, по специальным формулам вычисляется примерная численность животных, активных в зимний период – кабана, косули, лося, волка, рыси, лисицы, куницы, горностая, хоря, ласки, норки, белки, зайцев (беляка и русака), благородного оленя.

Так, было выяснено, что численность кабанов после АЧС восстанавливается, по сравнению с прошлым годом она несколько увеличилась и составила 89 особей. Численность лося, лисиц осталась практически на уровне прошлого года — 624  и  317 особей соответственно.

Отмечено возрастание численности зайца – беляка (627 особей), косули сибирской (1141 особь), куницы лесной (271 особь), что связано  с естественными колебаниями численности популяций этих животных. На протяжении последних 10 лет продолжается тенденция к уменьшению численности крупных хищников — волка, рыси. По результатам учетов последние 2 года их следов не обнаружено.